Το 1979, αμέσως μετά τον θάνατο του Μποδοσάκη, το Ίδρυμα ανακοίνωσε τη διεξαγωγή ενός μεγάλου έργου εις μνήμην του. Μετά από συνεννόηση με την τότε Κυβέρνηση, αποφασίστηκε η δημιουργία ενός σύγχρονου γενικού νοσοκομείου στη Δυτική Μακεδονία που θα έφερε το όνομα του Μποδοσάκη.
Οι εργασίες ανέγερσης ξεκίνησαν το 1982, και το Ίδρυμα παρέδωσε το έργο στο Υπουργείο Υγείας και Πρόνοιας το 1989, αφού είχε ολοκληρωθεί το κτίριο του νοσοκομείου και τα εξωτερικά ιατρεία. Τελικά, τα εγκαίνια του Μποδοσάκειου Νοσοκομείου Πτολεμαΐδας πραγματοποιήθηκαν τον Αύγουστο του 1992. Η συνολική δαπάνη του Ιδρύματος για το έργο αυτό αντιστοιχεί σήμερα σε €27.400.000.