Ο Μποδοσάκης, λόγω της προσωπικής του εμπειρίας, αναγνώριζε από πολύ νωρίς τη σημασία της εκπαίδευσης και των ίσων ευκαιριών πρόσβασης σε αυτή. Έτσι, πολλές από τις δωρεές του είχαν ως στόχο την ενίσχυση της παιδείας. Μία εξ αυτών είναι η δωρεά για την ανέγερση σχολείου, το οποίο φέρει και το όνομά του, στο Ηράκλειο Κρήτης. Το κτίριο ξεκίνησε τη λειτουργία του τη δεκαετία του 1930.